一、原料不同
　　1、聚合物水泥防水涂料：一種以聚丙烯酸酯乳液、乙烯-醋酸乙烯酯共聚乳液等聚合物乳液與各種添加劑組成的有機液料。
　　2、聚合物防水砂漿：一種特種水泥，主要成分是由水泥、骨料和可以分散在水中的有機聚合物攪拌而成的。
　　二、特點不同
　　1、聚合物水泥防水涂料：聚合物水泥防水涂料是和水泥、石英砂、輕重質碳酸鈣等無機填料及各種添加劑所組成的無機粉料通過合理配比、復合制成的一種雙組份、水性建筑防水涂料。在建筑工程中，JS-復合防水涂料和水泥聚合物防水涂料是同一種材料。
　　2、聚合物防水砂漿：防水抗滲效果好；粘結強度高，能與結構形成一體；抗腐蝕能力強；耐高濕、耐老化、抗凍性好。
　　三、應用不同
　　1、聚合物水泥防水涂料：聚合物水泥防水涂料適用于非暴露露臺、廁浴間及外墻的防水、防滲和防潮的工程（II型），也適用于暴露的屋面（I型）。地下工程以及隧道、洞庫等涂膜防水（I型）　
　　2、聚合物防水砂漿：外墻面、屋面、廁浴間、水池等建筑物各部位的防水，防滲漏工程。地下室、隧道、堤壩、地鐵等各種地下工程的防水、防滲漏工程。特別適用于加氣混凝土，空心磚等多孔材料的墻體防滲漏抹面或涂刷。